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干貨 | qPCR 實驗中關于 CT 值問題的詳細攻略(中)

發布時間:2019-11-08 13:55 信息來源: 閱讀次數: 次

NTC(無模板陰性對照)出現 CT 值,目的基因的 CT 值還能使用嗎?


NTC(無模板陰性對照)出現擴增一般會有兩種情況:


(1)通過觀察融解曲線,NTC 與目的基因融解曲線峰形不重疊。一般 NTC 的 Tm 值較目的基因 Tm 值小。


image.png


這種情況下,NTC 的 C值是由引物二聚體造成的,并不影響目的基因 C值的采集。


(2)NTC 與目的基因融解曲線峰形重疊。NTC 的 Tm 值等于目的基因的 Tm 值。


image.png


這種情況下,說明體系已被氣溶膠污染了。那么,體系被污染,目的基因的 C值還能正常使用嗎?


需要計算目的基因的 C值與 NTC 的 C值的差值(△CT)來判定。


若 △C≥ 5,說明氣溶膠帶來的污染對體系影響非常小,可以忽略不計。


如果達不到 △C≥ 5 的程度,△C≥ 3 也可以認為氣溶膠的污染程度很低,目的基因的 C值可正常使用。


若 △C< 3,說明污染已經很嚴重了,目的基因的 C值是不能使用的。


未完待續...

轉自:諾唯贊